KNOWLEDGE HYPERMARKET


Принцип кодирования аминокислотных последовательностей
 
Строка 5: Строка 5:
<br>  
<br>  
-
'''&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5.5.3. Принцип кодирования аминокислотных последовательностей '''<br><br>Для&nbsp; развития&nbsp; организма&nbsp; и&nbsp; стабильности&nbsp; его&nbsp; клеток&nbsp; в&nbsp; первую&nbsp; очередь необходим&nbsp; непрерывный&nbsp; синтез&nbsp; белков,&nbsp; то&nbsp; есть&nbsp; определенной&nbsp; последовательности&nbsp; аминокислот.&nbsp; Какой&nbsp; способ&nbsp; нашла&nbsp; природа&nbsp; для&nbsp; кодирования,&nbsp; то есть для информационно&nbsp; значимой&nbsp; записи порядка следования аминокислот в&nbsp; белках?&nbsp; Путем&nbsp; тонких&nbsp; биохимических&nbsp; экспериментов&nbsp; на&nbsp; молекулярном уровне за последние есятилетия удалось выяснить, что последовательность синтеза белков зафиксирована в цепях ДНК (в <br>некоторых&nbsp; случаях&nbsp; и&nbsp; РНК)&nbsp; в&nbsp; виде&nbsp; кодонов. Кодоном&nbsp; является&nbsp; тройка&nbsp; последовательно расположенных азотистых оснований. <br><br>Каждый&nbsp; отдельный&nbsp; белок&nbsp; кодируется своим&nbsp; геном -&nbsp; вполне&nbsp; определенной&nbsp; последовательностью кодонов. Сколько аминокислот в данном белке - столько и кодонов. Между собой&nbsp; гены&nbsp; разделены&nbsp; интронами -&nbsp; участками цепи&nbsp; ДНК,&nbsp; в&nbsp; которой&nbsp; нуклеотиды&nbsp; располагаются на первый взгляд беспорядочно, так, что кодонов не выделяется. <br><br>[[Image:33-02-05.jpg]]<br><br>По современным представлениям интроны выполняют&nbsp; служебную&nbsp; роль меток&nbsp; и&nbsp; участвуют&nbsp; в&nbsp; процессах «выбора»&nbsp; тех&nbsp; конкретных участков-генов, которые должны в тот или иной момент транскрибироваться. Дело&nbsp; в&nbsp; том, что, хотя почти&nbsp; все клетки организма&nbsp; содержат&nbsp; в&nbsp; своих хромосомах одну и ту же генетическую информацию, в разных клетках синтезируется только ограниченный, определенный специализацией клетки, набор белков. &nbsp;<br><br>Как ни&nbsp; удивительно, но&nbsp; к подобному же принципу&nbsp; расположения информационных&nbsp; файлов&nbsp; или&nbsp; музыкальных&nbsp; программ&nbsp; пришли&nbsp; в&nbsp; технологии компакт-дисков. Выбором определенной команды на управление Вы можете активировать (считывать,&nbsp; прослушивать)&nbsp; интересующий&nbsp; Вас&nbsp; в&nbsp; данный&nbsp; момент фрагмент записи. <br><br>Таким&nbsp; образом,&nbsp; генетическая&nbsp; информация,&nbsp; содержащаяся&nbsp; в&nbsp; ДНК&nbsp; и РНК, заключена в последовательности расположения нуклеотидов в этих молекулах. Каким же образом ДНК кодирует (шифрует) первичную структуру белков? Суть кода заключается в том, что последовательность расположения нуклеотидов&nbsp; в&nbsp; ДНК&nbsp; определяет&nbsp; последовательность&nbsp; расположения&nbsp; аминокислот в белках. Этот код называется генетическим, его расшифровка - одно из величайших достижений современного естествознания [8]. &nbsp;<br><br>В&nbsp; состав ДНК&nbsp; входят&nbsp; по 4&nbsp; нуклеотида. Если&nbsp; в&nbsp; алфавите жизни&nbsp; всего&nbsp; 4 буквы, то как из них строятся слова? Этот вопрос одним из первых поставил&nbsp; Г.А.&nbsp; Гамов. Двухбуквенный&nbsp; код&nbsp; позволил&nbsp; бы&nbsp; зашифровать&nbsp; всего&nbsp; лишь&nbsp; 16 аминокислот, так как из 4-х нуклеотидов можно составить только 16 различных&nbsp; комбинаций,&nbsp; в&nbsp; каждую&nbsp; из&nbsp; которых&nbsp; входит&nbsp; по 2&nbsp; нуклеотида.&nbsp; Этого мало&nbsp; для 20&nbsp; аминокислот, используемых&nbsp; в природе&nbsp; для&nbsp; синтеза&nbsp; белков. Гамов&nbsp; сделал&nbsp; предположение,&nbsp; что&nbsp; в&nbsp; каждом&nbsp; слове&nbsp; должно&nbsp; быть&nbsp; три&nbsp; буквы. С помощью триплетного кода можно создать из 4-х нуклеотидов 64 различные комбинации: 4 в степени 3 равно 64. Это уже заметно больше числа аминокислот. <br>&nbsp;<br>Как быть? Считать, что слова не обязательно состоят из трех букв? Или среди 64&nbsp; слов&nbsp; есть&nbsp; синонимы?&nbsp; Гамов&nbsp; остановился&nbsp; на&nbsp; второй&nbsp; возможности: некоторые&nbsp; слова (кодоны)&nbsp; могут&nbsp; обозначать&nbsp; одну&nbsp; и&nbsp; ту&nbsp; же&nbsp; аминокислоту. Экспериментальные исследования подтвердили&nbsp; гипотезу Гамова - почти каждая&nbsp; аминокислота шифруется&nbsp; более&nbsp; чем&nbsp; одним&nbsp; кодоном. Например,&nbsp; аргинин, серин и лейцин могут кодироваться шестью вариантами кодонов. Тем не менее,&nbsp; генетический&nbsp; код&nbsp; однозначен.&nbsp; Каждый&nbsp; триплет -&nbsp; кодон -&nbsp; шифрует только&nbsp; одну&nbsp; из&nbsp; аминокислот.&nbsp; В&nbsp; генетическом&nbsp; коде&nbsp; существуют&nbsp; три&nbsp; специальные триплета УГА, УАГ и УАА, каждый из которых обозначает прекращение синтеза цепи белка. Внутри гена не должно быть знаков препинания. Это очень важно. Например, мы можем легко прочитать и понять фразу, составленную триплетами обычных букв алфавита: «жил был кот тих был сер мил мне тот кот». Если убрать фиксированное начало, одну букву (или один нуклеотид в гене), то новые тройки букв (мы должны читать по тройным сочетаниям -&nbsp; кодонам)&nbsp; станут&nbsp; такими:&nbsp; «илб ылк&nbsp; отт&nbsp; ихо ылс&nbsp; ерм&nbsp; илм&nbsp; нет отк». У всех здоровых людей в гене, несущем информацию об одной из цепей гемоглобина, триплет ГАА или ГАГ, стоящий на шестом месте, кодирует глутаминовую кислоту. Если второй нуклеотид в этих триплетах будет заменен на У, то в этом случае вместо глутаминовой кислоты будет встраиваться валин. Последствия будут тяжелыми - все эритроциты у такого человека будут иметь «испорченный» гемоглобин, что вызовет болезнь - серповидноклеточную анемию. <br><br>Одна их форм шизофрении - кататония - связана с заменой всего одной аминокислоты на другую в белке WKL1. Его код содержится в одном из генов&nbsp; хромосомы 22&nbsp; человека. Единственная «опечатка»&nbsp; в&nbsp; генетическом&nbsp; коде приводит к развитию тяжелого психического заболевания. &nbsp;<br><br><br><br><br>
+
'''&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5.5.3. Принцип кодирования аминокислотных последовательностей '''<br><br>Для&nbsp; развития&nbsp; организма&nbsp; и&nbsp; стабильности&nbsp; его&nbsp; клеток&nbsp; в&nbsp; первую&nbsp; очередь необходим&nbsp; непрерывный&nbsp; [[Синтез_белков|синтез&nbsp; белков]],&nbsp; то&nbsp; есть&nbsp; определенной&nbsp; последовательности&nbsp; аминокислот.&nbsp; Какой&nbsp; способ&nbsp; нашла&nbsp; природа&nbsp; для&nbsp; кодирования,&nbsp; то есть для информационно&nbsp; значимой&nbsp; записи порядка следования аминокислот в&nbsp; белках?&nbsp; Путем&nbsp; тонких&nbsp; биохимических&nbsp; экспериментов&nbsp; на&nbsp; молекулярном уровне за последние есятилетия удалось выяснить, что последовательность синтеза белков зафиксирована в цепях ДНК (в <br>некоторых&nbsp; случаях&nbsp; и&nbsp; РНК)&nbsp; в&nbsp; виде&nbsp; кодонов. Кодоном&nbsp; является&nbsp; тройка&nbsp; последовательно расположенных азотистых оснований. <br><br>Каждый&nbsp; отдельный&nbsp; белок&nbsp; кодируется своим&nbsp; геном -&nbsp; вполне&nbsp; определенной&nbsp; последовательностью кодонов. Сколько [[Аминокислоты_и_белки|аминокислот]] в данном белке - столько и кодонов. Между собой&nbsp; гены&nbsp; разделены&nbsp; интронами -&nbsp; участками цепи&nbsp; ДНК,&nbsp; в&nbsp; которой&nbsp; нуклеотиды&nbsp; располагаются на первый взгляд беспорядочно, так, что кодонов не выделяется. <br><br>[[Image:33-02-05.jpg|кодон]]<br><br>По современным представлениям интроны выполняют&nbsp; служебную&nbsp; роль меток&nbsp; и&nbsp; участвуют&nbsp; в&nbsp; процессах «выбора»&nbsp; тех&nbsp; конкретных участков-генов, которые должны в тот или иной момент транскрибироваться. Дело&nbsp; в&nbsp; том, что, хотя почти&nbsp; все клетки организма&nbsp; содержат&nbsp; в&nbsp; своих хромосомах одну и ту же генетическую информацию, в разных клетках синтезируется только ограниченный, определенный специализацией клетки, набор белков. &nbsp;<br><br>Как ни&nbsp; удивительно, но&nbsp; к подобному же принципу&nbsp; расположения информационных&nbsp; файлов&nbsp; или&nbsp; музыкальных&nbsp; программ&nbsp; пришли&nbsp; в&nbsp; технологии компакт-дисков. Выбором определенной команды на управление Вы можете активировать (считывать,&nbsp; прослушивать)&nbsp; интересующий&nbsp; Вас&nbsp; в&nbsp; данный&nbsp; момент фрагмент записи. <br><br>Таким&nbsp; образом,&nbsp; генетическая&nbsp; информация,&nbsp; содержащаяся&nbsp; в&nbsp; [[Тема_9._Нуклеїнові_кислоти:_ДНК_та_РНК.|ДНК]]&nbsp; и РНК, заключена в последовательности расположения нуклеотидов в этих молекулах. Каким же образом ДНК кодирует (шифрует) первичную структуру белков? Суть кода заключается в том, что последовательность расположения нуклеотидов&nbsp; в&nbsp; ДНК&nbsp; определяет&nbsp; последовательность&nbsp; расположения&nbsp; [[Аминокислоты_и_белки|аминокислот]] в белках. Этот код называется генетическим, его расшифровка - одно из величайших достижений современного естествознания [8]. &nbsp;<br><br>В&nbsp; состав ДНК&nbsp; входят&nbsp; по 4&nbsp; нуклеотида. Если&nbsp; в&nbsp; алфавите жизни&nbsp; всего&nbsp; 4 буквы, то как из них строятся слова? Этот вопрос одним из первых поставил&nbsp; Г.А.&nbsp; Гамов. Двухбуквенный&nbsp; код&nbsp; позволил&nbsp; бы&nbsp; зашифровать&nbsp; всего&nbsp; лишь&nbsp; 16 аминокислот, так как из 4-х нуклеотидов можно составить только 16 различных&nbsp; комбинаций,&nbsp; в&nbsp; каждую&nbsp; из&nbsp; которых&nbsp; входит&nbsp; по 2&nbsp; нуклеотида.&nbsp; Этого мало&nbsp; для 20&nbsp; аминокислот, используемых&nbsp; в природе&nbsp; для&nbsp; синтеза&nbsp; белков. Гамов&nbsp; сделал&nbsp; предположение,&nbsp; что&nbsp; в&nbsp; каждом&nbsp; слове&nbsp; должно&nbsp; быть&nbsp; три&nbsp; буквы. С помощью триплетного кода можно создать из 4-х нуклеотидов 64 различные комбинации: 4 в степени 3 равно 64. Это уже заметно больше числа аминокислот. <br>&nbsp;<br>Как быть? Считать, что слова не обязательно состоят из трех букв? Или среди 64&nbsp; слов&nbsp; есть&nbsp; синонимы?&nbsp; Гамов&nbsp; остановился&nbsp; на&nbsp; второй&nbsp; возможности: некоторые&nbsp; слова (кодоны)&nbsp; могут&nbsp; обозначать&nbsp; одну&nbsp; и&nbsp; ту&nbsp; же&nbsp; аминокислоту. Экспериментальные исследования подтвердили&nbsp; гипотезу Гамова - почти каждая&nbsp; аминокислота шифруется&nbsp; более&nbsp; чем&nbsp; одним&nbsp; кодоном. Например,&nbsp; аргинин, серин и лейцин могут кодироваться шестью вариантами кодонов. Тем не менее,&nbsp; генетический&nbsp; код&nbsp; однозначен.&nbsp; Каждый&nbsp; триплет -&nbsp; кодон -&nbsp; шифрует только&nbsp; одну&nbsp; из&nbsp; аминокислот.&nbsp; В&nbsp; генетическом&nbsp; коде&nbsp; существуют&nbsp; три&nbsp; специальные триплета УГА, УАГ и УАА, каждый из которых обозначает прекращение синтеза цепи белка. Внутри гена не должно быть знаков препинания. Это очень важно. Например, мы можем легко прочитать и понять фразу, составленную триплетами обычных букв алфавита: «жил был кот тих был сер мил мне тот кот». Если убрать фиксированное начало, одну букву (или один нуклеотид в гене), то новые тройки букв (мы должны читать по тройным сочетаниям -&nbsp; кодонам)&nbsp; станут&nbsp; такими:&nbsp; «илб ылк&nbsp; отт&nbsp; ихо ылс&nbsp; ерм&nbsp; илм&nbsp; нет отк». У всех здоровых людей в гене, несущем информацию об одной из цепей гемоглобина, триплет ГАА или ГАГ, стоящий на шестом месте, кодирует глутаминовую кислоту. Если второй нуклеотид в этих триплетах будет заменен на У, то в этом случае вместо глутаминовой кислоты будет встраиваться валин. Последствия будут тяжелыми - все эритроциты у такого человека будут иметь «испорченный» гемоглобин, что вызовет [[История_болезни|болезнь ]]- серповидноклеточную анемию. <br><br>Одна их форм шизофрении - кататония - связана с заменой всего одной аминокислоты на другую в белке WKL1. Его код содержится в одном из генов&nbsp; хромосомы 22&nbsp; человека. Единственная «опечатка»&nbsp; в&nbsp; генетическом&nbsp; коде приводит к развитию тяжелого психического заболевания. &nbsp;<br><br><br><br><br>
<br>  
<br>  

Текущая версия на 10:33, 9 июля 2012

Гипермаркет знаний>>Естествознание>>Естествознание 11 класс>> Принцип кодирования аминокислотных последовательностей


                                         5.5.3. Принцип кодирования аминокислотных последовательностей

Для  развития  организма  и  стабильности  его  клеток  в  первую  очередь необходим  непрерывный  синтез  белков,  то  есть  определенной  последовательности  аминокислот.  Какой  способ  нашла  природа  для  кодирования,  то есть для информационно  значимой  записи порядка следования аминокислот в  белках?  Путем  тонких  биохимических  экспериментов  на  молекулярном уровне за последние есятилетия удалось выяснить, что последовательность синтеза белков зафиксирована в цепях ДНК (в
некоторых  случаях  и  РНК)  в  виде  кодонов. Кодоном  является  тройка  последовательно расположенных азотистых оснований.

Каждый  отдельный  белок  кодируется своим  геном -  вполне  определенной  последовательностью кодонов. Сколько аминокислот в данном белке - столько и кодонов. Между собой  гены  разделены  интронами -  участками цепи  ДНК,  в  которой  нуклеотиды  располагаются на первый взгляд беспорядочно, так, что кодонов не выделяется.

кодон

По современным представлениям интроны выполняют  служебную  роль меток  и  участвуют  в  процессах «выбора»  тех  конкретных участков-генов, которые должны в тот или иной момент транскрибироваться. Дело  в  том, что, хотя почти  все клетки организма  содержат  в  своих хромосомах одну и ту же генетическую информацию, в разных клетках синтезируется только ограниченный, определенный специализацией клетки, набор белков.  

Как ни  удивительно, но  к подобному же принципу  расположения информационных  файлов  или  музыкальных  программ  пришли  в  технологии компакт-дисков. Выбором определенной команды на управление Вы можете активировать (считывать,  прослушивать)  интересующий  Вас  в  данный  момент фрагмент записи.

Таким  образом,  генетическая  информация,  содержащаяся  в  ДНК  и РНК, заключена в последовательности расположения нуклеотидов в этих молекулах. Каким же образом ДНК кодирует (шифрует) первичную структуру белков? Суть кода заключается в том, что последовательность расположения нуклеотидов  в  ДНК  определяет  последовательность  расположения  аминокислот в белках. Этот код называется генетическим, его расшифровка - одно из величайших достижений современного естествознания [8].  

В  состав ДНК  входят  по 4  нуклеотида. Если  в  алфавите жизни  всего  4 буквы, то как из них строятся слова? Этот вопрос одним из первых поставил  Г.А.  Гамов. Двухбуквенный  код  позволил  бы  зашифровать  всего  лишь  16 аминокислот, так как из 4-х нуклеотидов можно составить только 16 различных  комбинаций,  в  каждую  из  которых  входит  по 2  нуклеотида.  Этого мало  для 20  аминокислот, используемых  в природе  для  синтеза  белков. Гамов  сделал  предположение,  что  в  каждом  слове  должно  быть  три  буквы. С помощью триплетного кода можно создать из 4-х нуклеотидов 64 различные комбинации: 4 в степени 3 равно 64. Это уже заметно больше числа аминокислот.
 
Как быть? Считать, что слова не обязательно состоят из трех букв? Или среди 64  слов  есть  синонимы?  Гамов  остановился  на  второй  возможности: некоторые  слова (кодоны)  могут  обозначать  одну  и  ту  же  аминокислоту. Экспериментальные исследования подтвердили  гипотезу Гамова - почти каждая  аминокислота шифруется  более  чем  одним  кодоном. Например,  аргинин, серин и лейцин могут кодироваться шестью вариантами кодонов. Тем не менее,  генетический  код  однозначен.  Каждый  триплет -  кодон -  шифрует только  одну  из  аминокислот.  В  генетическом  коде  существуют  три  специальные триплета УГА, УАГ и УАА, каждый из которых обозначает прекращение синтеза цепи белка. Внутри гена не должно быть знаков препинания. Это очень важно. Например, мы можем легко прочитать и понять фразу, составленную триплетами обычных букв алфавита: «жил был кот тих был сер мил мне тот кот». Если убрать фиксированное начало, одну букву (или один нуклеотид в гене), то новые тройки букв (мы должны читать по тройным сочетаниям -  кодонам)  станут  такими:  «илб ылк  отт  ихо ылс  ерм  илм  нет отк». У всех здоровых людей в гене, несущем информацию об одной из цепей гемоглобина, триплет ГАА или ГАГ, стоящий на шестом месте, кодирует глутаминовую кислоту. Если второй нуклеотид в этих триплетах будет заменен на У, то в этом случае вместо глутаминовой кислоты будет встраиваться валин. Последствия будут тяжелыми - все эритроциты у такого человека будут иметь «испорченный» гемоглобин, что вызовет болезнь - серповидноклеточную анемию.

Одна их форм шизофрении - кататония - связана с заменой всего одной аминокислоты на другую в белке WKL1. Его код содержится в одном из генов  хромосомы 22  человека. Единственная «опечатка»  в  генетическом  коде приводит к развитию тяжелого психического заболевания.  





Концепции современного естествознания. Стародубцев В.А., 2-е изд., доп. — Томск.: Том. политех. ун-т, 2002. — 184 с.



Содержание урока
1236084776 kr.jpg конспект урока
1236084776 kr.jpg опорный каркас  
1236084776 kr.jpg презентация урока
1236084776 kr.jpg акселеративные методы 
1236084776 kr.jpg интерактивные технологии 

Практика
1236084776 kr.jpg задачи и упражнения 
1236084776 kr.jpg самопроверка
1236084776 kr.jpg практикумы, тренинги, кейсы, квесты
1236084776 kr.jpg домашние задания
1236084776 kr.jpg дискуссионные вопросы
1236084776 kr.jpg риторические вопросы от учеников

Иллюстрации
1236084776 kr.jpg аудио-, видеоклипы и мультимедиа 
1236084776 kr.jpg фотографии, картинки 
1236084776 kr.jpg графики, таблицы, схемы
1236084776 kr.jpg юмор, анекдоты, приколы, комиксы
1236084776 kr.jpg притчи, поговорки, кроссворды, цитаты

Дополнения
1236084776 kr.jpg рефераты
1236084776 kr.jpg статьи 
1236084776 kr.jpg фишки для любознательных 
1236084776 kr.jpg шпаргалки 
1236084776 kr.jpg учебники основные и дополнительные
1236084776 kr.jpg словарь терминов                          
1236084776 kr.jpg прочие 

Совершенствование учебников и уроков
1236084776 kr.jpg исправление ошибок в учебнике
1236084776 kr.jpg обновление фрагмента в учебнике 
1236084776 kr.jpg элементы новаторства на уроке 
1236084776 kr.jpg замена устаревших знаний новыми 

Только для учителей
1236084776 kr.jpg идеальные уроки 
1236084776 kr.jpg календарный план на год  
1236084776 kr.jpg методические рекомендации  
1236084776 kr.jpg программы
1236084776 kr.jpg обсуждения


Интегрированные уроки


Если у вас есть исправления или предложения к данному уроку, напишите нам.

Если вы хотите увидеть другие корректировки и пожелания к урокам, смотрите здесь - Образовательный форум.